emmax
[Efficient Mixed-Model Association eXpedited]. Herramienta bioinformática utilizada en estudios de asociación del genoma completo [Genome-Wide Association Study - GWAS] para identificar variantes genéticas asociadas con rasgos fenotípicos, teniendo en cuenta la estructura de la población y las relaciones de parentesco. EMMAX utiliza formatos .BED para genotipos y archivos de texto para fenotipos.
$ emmax-kin -v -h -s -d 10 genotipos.bed
genera la matriz de parentesco a partir del archivo de genotipos en formato BED
$ emmax -v -d 10 -t genotipos -p fenotipos.txt -k genotipos.hIBS.kinf -o resultados
realiza el análisis de asociación utilizando los archivos especificados y genera los resultados en un archivo de salida